Avis d’appel à candidature pour une thèse de doctorat à l’Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer (Ifremer) sur le Sujet « Echelles de structuration spatiale des coraux d’eau froide : Apports de l’intelligence artificielle », France
DESCRIPTION DE L’OFFRE
Poste à pourvoir: Thèse : Echelles de structuration spatiale des coraux d’eau froide : Apports de l’intelligence artificielle (H/F)
Référence du poste : PV-2023-1287
Structure d’accueil : Département des Ressources Physiques et Ecosystemes de fond de Mer
Unité Biologie et Ecologie des Environnements Marins Profonds
Laboratoire Environnement Profond
Localisation : Brest, Bretagne, FR
Durée du contrat : 3 ans
Date de clôture de réception de candidatures : 23/04/2023
Description de l’offre:
L’UMR BEEP (Biologie et Ecologie des Ecosystèmes marins profonds) a pour objectif d’étudier la biologie et l’écologie des écosystèmes marins profonds par une approche multidisciplinaire et holistique, des microorganismes à la mégafaune, et de la molécule à la communauté. Les recherches portent sur la description et la dynamique de la diversité biologique, les interactions biotiques et avec l’environnement ainsi que l’adaptation et la réponse des systèmes biologiques sous contraintes naturelles et d’origine anthropique. Ces problématiques sont abordées à différentes échelles spatiales et temporelles en fonction des écosystèmes étudiés : écosystèmes chimiosynthétiques, coraux d’eau froide, monts sous-marins ou plaines abyssales.
https://www.umr-beep.fr/
Résumé de la thèse
Les canyons sous-marins constituent l’une des géoformes les plus grandes et complexes du milieu profond, abritant une large diversité d’habitats, dont des coraux d’eau froide, et supportant de nombreux services écosystémiques. Un défi dans l’étude de ces environnements complexes est l’intégration des échelles de structuration spatiale, de la géoforme à l’organisme. A chaque échelle correspond des processus écologiques, des techniques d’acquisition et des algorithmes de traitement.
L’objectif de la thèse sera de réaliser une cartographie pluriannuelle et multi-échelle des habitats du canyon sous-marin de Lampaul afin d’évaluer et de suivre l’état de santé des habitats coralliens. Au-delà de la surveillance environnementale, cette cartographie multi-échelle sera également utilisée pour mieux comprendre les processus et facteurs qui régissent la distribution des coraux et leurs dynamiques. L’importance du rôle ingénieur des coraux (récifaux ou non) sur leurs fonctions écosystémiques sera également investiguée.
A cette fin, un flux d’analyse intégrant les multiples échelles spatiales sera développé pour opérationnaliser, accélérer et automatiser l’utilisation des données d’imagerie pour la cartographie des habitats benthiques.
Mots-clés
Canyon sous-marin, coraux d’eau froide, cartographie haute résolution, photogrammétrie, apprentissage profond, modélisation prédictive
Profil recherché
- Master 2 et/ou école d’ingénieur en écologie, océanographie, biostatistique ou équivalent ;
- Intérêt et bonnes connaissances en écologie marine et en biostatistiques spatiales ;
- Maitrise des outils numériques utilisés en traitement d’image (Python, C++, …) et en biostatistique (R) ;
- Compétences et/ou connaissances en vision par ordinateur (apprentissage machine, photogrammétrie) et en traitement de données 3D appréciées ;
- Maitrise de l’anglais.
Conditions de travail
- Le travail de recherche s’effectuera dans les locaux du centre Ifremer Bretagne à Plouzané.
- Des déplacements pourront avoir lieu en France et à l’étranger, incluant un séjour de quelques semaines dans un laboratoire étranger.
- La thèse impliquera des expérimentations en mer
Véritable opportunité de travailler sur les thématiques prioritaires de l’Ifremer, les contrats doctoraux proposés par l’Ifremer ouvrent droit, pour une durée de 3 ans, à une rémunération forfaitaire mensuelle brute égale à 2300 euros brut, non cumulable avec d’autres bourses d’étude.
Comment postuler ?
Le dossier de candidature doit comprendre :
- un CV ;
- une lettre de motivation ;
- une lettre de référence ;
- un relevé de notes (Licence + Master 1 et premier semestre Master 2).
L’ensemble des documents doit être déposé sur ce site sous la forme de 2 documents.PDF. Chaque document pouvant aller jusqu’à 3 MB.
Si vous rencontrez un problème pour joindre vos documents, merci de déposer votre CV sur ce site (Pour que nous puissions assurer le suivi, cette démarche est obligatoire pour la prise en compte de votre candidature) et d’envoyer votre dossier par au directeur de thèse : lenaick.menot@ifremer.fr
Nous vous invitons à déposer en parallèle votre dossier auprès de l’Ecole doctorale : Ecole Doctorale des Sciences de Mer et du Littoral (https://theses.doctorat-bretagneloire.fr/sml/campagne-2023)
La date limite pour la remise des candidatures est le 23 avril 2023. Néanmoins, nous vous engageons fortement à faire part dès que possible de votre intention de postuler, en prenant contact avec le responsable de sujet.
Les contrats des doctorants démarreront à compter du 2 octobre 2023, sous réserve de la production par le doctorant des documents administratifs autorisant son recrutement par l’Ifremer (attestation de réussite au master 2 ou diplôme d’ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors U.E.).
L’Ifremer
Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.
Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et des abysses à l’interface avec l’atmosphère.
Ouverts sur la communauté scientifique internationale, ses 1500 chercheurs, ingénieurs et techniciens font progresser les connaissances sur l’une des dernières frontières inexplorées de notre planète ; ils contribuent à éclairer les politiques publiques et à l’innovation pour une économie bleue durable. Leur mission consiste aussi à sensibiliser le grand public aux enjeux maritimes.
Fondé en 1984, l’Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), dont le budget avoisine 240 millions d’Euros. Il est placé sous la tutelle conjointe des ministères de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation (MESRI), de la Mer (MinMer), de la Transition écologique et solidaire (MTES), de l’Agriculture et de l’Alimentation (MAA).
Pour postuler
Date de clôture de réception de candidatures : 23/04/2023
Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.
